随着北京大运河博物馆开馆，运河风物、运河书屋、码头小叙、运河食舫和运河小铺五大文创空间开门迎客。目前，该馆依托馆藏资源开发了500余种文创产品，观众可以亲自动手唤醒“文物”，把运河礼物带回家。
北京大运河博物馆展陈大楼一层，走进“运河风物”文创中心，围绕馆藏文物、大运河文化及传统文化，该馆推出了龙生九子、大运河舟楫、古建筑系列等八大类500余种文创产品。在互动区域，观众可以通过打卡互动的方式，了解运河文化历史，体验榫卯、书法、纸扇、灯笼等丰富的传统技艺。
北京大运河博物馆主题邮局是文创中心里的一方独立主题空间，设有一台古法凸版印刷机。观众可以借用凸版印刷机，亲自动手制作一张古法手工凸版印刷邮政明信片，现场寄出这份带着历史温度的礼物。北京大运河博物馆开馆纪念封是中国邮政专为该馆开馆纪念定制的邮政产品，纪念封正面主图采用黑白素描的博物馆建筑外观鸟瞰图，主图右下侧配红色“北京大运河博物馆”篆刻印章。纪念封所贴邮票主图为中国结，附图采用彩色手绘版博物馆建筑外观鸟瞰图，与主图交相辉映。邮票上盖有“北京通州 张家湾”邮政收寄日戳，以邮政独有的元素将博物馆所处的地理位置和开馆日期铭记，具有收藏价值和纪念意义。
文创中心内还设置了互动纪念章刻字机，观众可以亲手制作一枚专属定制款纪念章。纪念章正面以北京大运河博物馆建筑外观、大运河舟楫、馆藏文物“铜坐龙”、京杭大运河保护与申遗纪念标等图案为原型，观众可以选择自己喜欢的一款，在纪念章背面进行二次创作。
在北京大运河博物馆，观众还可以品尝到一系列可以吃的文创。码头小叙和运河食舫提供正餐、中西简餐等各类运河主题餐食。其中，文创雪糕以大运河上的船楫和燃灯塔为创意元素，慕斯蛋糕以中华传统文化龙生九子为原型进行二次创作，还有中式运河茶饮、运河创意茶点、运河糖葫芦等，好看又好吃的文创，让文物“活”起来，邀请观众品尝打卡。博物馆还专为饮品设计了运河沿途风物咖啡杯，请插画师把运河地图和沿线著名地标以彩绘的形式呈现在纸杯上，杯身展开就是大运河沿线彩绘地图。